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在獸用疫苗的生產過程中，尤其是細胞培養步驟中，很容易發生支原體污染，進而影響疫苗質量，會給疫苗生產商或養殖戶帶來經濟損失，同時也不利于畜禽疾病防控工作的順利開展。造成支原體污染的原因也較多，工作環境、培養基、被污染的細胞、試驗器材等都可能造成支原體的污染，從而使疫苗質量下降，安全性及免疫效果難以達到標準。
在日常的清潔與環境污染物監控過程中，應時刻關注支原體污染情況。
日常清潔中，應對實驗環境進行消殺，可采用消毒試劑，對試驗臺、地面、墻壁等表面進行擦拭，推薦使用支原體專用清除試劑——德國MB公司生產的Mycoplasma-off，即用型支原體祛除噴霧劑，直接將試劑噴灑在待清潔物表面即可，高效清除物體表面的支原體、真菌、細菌、等污染。
還應定期對培養物進行取樣檢測，監控培養物是否被支原體污染。PCR是一種很好的手段。根據支原體核糖體16s-23s rRNA的特異保守序列設計引物，對待檢樣本DNA進行擴增，通過對擴增產物的大小分析作出診斷。德國MB公司的支原體常規PCR檢測試劑盒，
①高特異性，一次檢測即可涵蓋了所有可能感染細胞的支原體物種（涵蓋歐洲藥典規定的9種支原體），根據序列一致性，至少可以檢測到107種支原體物種。操作簡單，易于觀察（使用MB的試劑盒，下表中列出的支原體物種均為陽性，其他微生物或真核細胞均為陰性，無交叉反應）。191bp為內控對照條帶，表明PCR反應正常。當樣本存在支原體污染時，由于內控對照與支原體DNA存在競爭，內控對照條帶變弱（例如支原體DNA＞10^3拷貝）。
②高靈敏度，1-5拷貝/μl的支原體DNA即可檢出。
③試劑盒含內控對照，可防止假陰性的發生。
④符合歐洲藥典要求。
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