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同源重組(HR)缺陷與DNA重排和細胞遺傳畸變有關。矛盾的是，與hr缺陷型癌癥相關的DNA重排類型對染色體結構的影響微乎其微。
近日，為了解決這一明顯的矛盾，研究人員結合了46例BRCA1-或brca2突變型乳腺癌的數千個具有深連鎖閱讀WGS的腫瘤的短讀全基因組測序(WGS)圖譜的基因組圖譜分析。
相關研究發表在《Nature》上，文章標題為：“Long-molecule scars of backup DNA repair in BRCA1- and BRCA2-deficient cancers"。
這些數據揭示了一類富含hr缺陷的重排，稱為互易對。鏈讀WGS顯示，具有相同重排取向的互反對產生了兩種不同的染色體結果之一，只能通過長分子數據來區分。一個(順式)結果對應于一個小片段的復制和粘貼到一個遙遠的位點，第二個(反式)結果是一個準平衡的易位或多兆堿基反轉，在每個節點上都有大量(10 kb)的重復。我們提出了一個獨立于hr的復制-重啟修復機制來解釋互惠對結果的全部范圍。鏈接閱讀WGS還發現單鏈退火是人類癌癥中BRCA2缺乏特異性的修復途徑。將這些特征整合到分類器中可以提高BRCA1-和brca2缺陷基因組之間的區分。
總之，該研究的數據揭示了在hr缺陷細胞中，BRCA1或BRCA2缺乏癥的重排類型是細胞遺傳畸變的來源。
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