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細(xì)胞類型特異性工具有助于識別和功能表征不同的細(xì)胞類型，形成復(fù)雜的神經(jīng)元回路。果蠅現(xiàn)有的大量遺傳工具依賴于增強子活性來標(biāo)記不同的細(xì)胞亞群，并且在分析成人的功能回路方面非常有用。
德國MB公司的PCR Clean，清除分子實驗過程中的DNA、RNA、DNA酶、RNA酶污染。
然而，這些基于增強子的GAL4系通常不能反映附近基因的表達，因為它們只代表了全部基因調(diào)控元件的一小部分。雖然諸如分裂- gal4系統(tǒng)等基因交叉技術(shù)進一步提高了細(xì)胞類型特異性，但它需要大量的時間和資源來通過增強子表達模式的組合進行篩選。
近日，研究人員使用現(xiàn)有的發(fā)育單細(xì)胞RNA測序(scRNAseq)數(shù)據(jù)集來選擇分裂- gal4的基因?qū)Γ⑻峁┮粋€高效和預(yù)測的管道(scMarco)來生成細(xì)胞類型特異性的分裂- gal4系，在任何時候在發(fā)育過程中，基于天然基因調(diào)控元件。這些基因特異性的分裂- gal4系可以從大量編碼內(nèi)含子MiMIC/CRIMIC系或CRISPR敲入中產(chǎn)生。我們使用發(fā)育中的果蠅視覺系統(tǒng)作為模型來證明scRNAseq引導(dǎo)的基因特異性分裂- gal4系在靶向已知細(xì)胞類型、注釋scRNAseq數(shù)據(jù)集中的簇以及識別新細(xì)胞類型方面的高預(yù)測能力。
最后，基因特異性分裂- gal4系廣泛適用于任何其他果蠅組織。研究人員的工作為生成細(xì)胞類型特異性工具開辟了新的途徑，用于在整個發(fā)育過程中靶向操縱不同的細(xì)胞類型，并為果蠅社區(qū)提供了寶貴的資源。
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