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吸煙和飲酒是與世界范圍內(nèi)15%和5.3%的死亡相關(guān)的遺傳行為，主要原因是疾病和傷害風(fēng)險(xiǎn)普遍增加。這些物質(zhì)在全球范圍內(nèi)都在使用，但全基因組關(guān)聯(lián)研究主要集中在歐洲血統(tǒng)的個(gè)體上。
近日，研究人員開發(fā)了一種多祖先元回歸方法，利用來自全球血統(tǒng)的四個(gè)主要臨床的340萬個(gè)體的全球遺傳多樣性(約21%非歐洲人)來支持與煙草和酒精使用相關(guān)的基因組位點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)和精細(xì)繪制，通過祖先感知轉(zhuǎn)錄組范圍的關(guān)聯(lián)研究來告知這些位點(diǎn)的功能，并評(píng)估遺傳結(jié)構(gòu)和多基因風(fēng)險(xiǎn)在人群內(nèi)部和人群之間的預(yù)測能力。
不同血統(tǒng)之間與酒精和煙草使用行為有關(guān)的基因有驚人的相似性，80%的基因變體在所研究的人群中顯示出一致的影響。
相關(guān)研究發(fā)表在《Nature》上，文章標(biāo)題為：“Genetic diversity fuels gene discovery for tobacco and alcohol use"。研究人員發(fā)現(xiàn)樣本量和遺傳多樣性的增加提高了位點(diǎn)識(shí)別和精細(xì)定位的分辨率，并且3823個(gè)相關(guān)變異(來自2143個(gè)位點(diǎn))中的絕大多數(shù)在祖先維度上表現(xiàn)出一致的效應(yīng)大小。然而，在一個(gè)祖先中形成的多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分在其他祖先中表現(xiàn)不佳，突出表明繼續(xù)需要增加不同祖先的樣本量，以實(shí)現(xiàn)多基因預(yù)測的任何潛在好處。
這里使用的元分析方法使用元回歸來解釋遺傳祖先變異的每個(gè)研究軸，并結(jié)合隨機(jī)效應(yīng)來捕獲給定遺傳變異效應(yīng)中進(jìn)一步無法解釋的異質(zhì)性。雖然這里的祖先是連續(xù)的，但研究人員也對(duì)反映四個(gè)祖先臨床的大陸群體進(jìn)行了二次分析，納入來自非洲、東亞和美國血統(tǒng)的人的基因數(shù)據(jù)集，并評(píng)估了多種吸煙和飲酒的特征，從開始飲酒或吸煙到開始定期使用和攝入量。利用機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)，他們確定了與這些行為有關(guān)的基因。
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