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細胞培養是一種無菌技術，要求工作環境和條件必須保證無微生物和不受其他有害因素的影響。為防止微生物污染和有害因素的影響，細胞培養室要求環境清潔，空氣清新、干燥、無塵。
細胞培養實驗室由無菌操作區、孵育區、制備區、儲藏區、清洗和消毒滅菌區6部分組成，這些區域的共同特點是房間要寬敞、明亮，地面要便于清潔、防滑，墻壁的質地光滑堅硬，儀器設備布局合理，方便操作，避免交叉干擾，陳設簡潔，便于清掃。
一、無菌室
無菌室的結構：一般由更衣間、緩沖間、操作間三部分組成。
無菌室的消毒和防污染：為保持無菌狀態，經常消毒是必要的，通常采用每日（使用前）紫外照射（1－2小時），每周甲醛、乳酸、過氧乙酸熏蒸（2小時）和每月新潔爾滅擦拭地面和墻壁一次的方式進行消毒。實際工作中，要根據無菌室建筑材料的差異來選擇合適的消毒方法。
此外，還應注意防止無菌室的污染。造成無菌室污染的可能包括：送入無菌室的風沒有被過濾除菌；進出無菌室時，能使外界空氣直接對流進無菌室的操作間；等。
二、超凈工作臺
工作原理：鼓風機驅動空氣通過高效過濾器得以凈化，凈化的空氣被徐徐吹過臺面空間而將其中的塵埃、細菌甚至病毒顆粒帶走，使工作區構成無菌環境。根據氣流在超凈工作臺的流動方向不同，可將超凈工作臺分為側流式、直流式和外流式三種類型。
超凈臺的使用與保養：超凈臺的平均風速保持在0.32-0.48米/秒為宜，過大、過小均不利于保持凈化度；使用前最好開啟超凈臺內紫外燈照射10－30分鐘，然后讓超凈臺預工作10－15分鐘，以除去臭氧和使用工作臺面空間呈凈化狀態；使用完畢后，要用70%酒精將臺面和臺內四周擦拭干凈，以保證超凈臺無菌。還要定期用福爾馬林熏蒸超凈臺。
德國MB生產的Mycoplasma-offTM噴霧劑，或濕巾擦拭 5-10分鐘清除，對支原體、細菌、真菌、霉菌、孢子祛除確切有效。無殘留, 無腐蝕, 無致癌性，操作簡單方便。
qPCR法介紹：
熒光定量PCR法（qPCR）：是在常規PCR基礎上，將『針對支原體特異性保守序列的探針』做熒光標記，使PCR擴增后的產物帶有熒光，利用熒光信號的變化和配套軟件，進行DNA擴增反應的實時監測，簡稱qPCR。
優點：①靈敏度高、特異性強。
②時間短，2-3小時出結果。
③檢測結果可定量。
④操作簡便。
缺點：①對于已做支原體滅活處理的樣品，由于支原體DNA仍舊存在其中，PCR結果會出現假陽性。（可用培養法做補充驗證）
②不同廠家生產的試劑盒質量差異巨大（由于引物及內在設計不同），需謹慎選擇，盡量在專業人員推薦指導下使用。
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